A Wii U está disponível em versões de 8 e 32 GB. No entanto, este é o espaço total disponível em disco. O espaço livre para o utilizador é cerca de 5 GB menor, ou seja, de 3 e 25 GB respetivamente.
A Nintendo publicou um vídeo, que o Kotaku traduziu e desmontou argumento a argumento aqui, a explicar as suas opções no que diz respeito ao espaço em disco.
Cerca de 10% do espaço é reservado para a formatação do sistema. Depois, 4,2 GB são guardados para dados como o software do sistema e os diferentes Miis. Os discos de jogos da Wii U tem 25 GB, portanto, mesmo na versão com maior capacidade vai ser difícil guardar alguns jogos descarregados da Internet.
A solução parece ser mesmo recorrer a unidades USB. Apesar de conseguir ler cartões de memória SD, estes só podem ser usados para guardar Miis e imagens e não servem de suporte de armazenamento externo.
